藏医有发达的外科手术治疗，包括涂擦疗法、放血、艾灸、穿刺、切除等。常用的外科器械分为以下几种：
    检查疼痛用的器械：头部圆形，钝而不锐，约六指长，称为针头，用于检查头部骨折；头部形状如荞麦，尖端呈钩形，似扬起的蛇头，约十二指长，细而柔软，用于检查四肢部位的疼痛；长度约八指，尖端有小孔的探针，用来检查肿胀部位是否化脓；状如乳头的空针，长度约三指，应用于男性者粗五指尖，应用于女性者粗六指尖，此器械用来检查痔疮。
    各种手术钳：有的如狮子嘴，有的象乌鸦嘴，长度约十八指，连结处钉有坚固的钉子。柄部铁钩处带有一个环，此器械用来检查、取出深入骨头的异物；长度约八指状如鸥嘴，特别细小，此器械用来检查、取出筋肉内的异物；空头管长约十二指呈坚固的管状，此器械用来检查取出伤口较深处的异物；镊子用来取出脉、筋及骨头的碎片等。
    放血用的各种器械：切开肌肉放血用刺针，形如麻雀的羽毛，长约六指，用于割刺肌肉间隙的血脉；刀尖极锐的靠背刀，在脏器和细微穴道部位放血；斧形手术刀，在靠近骨上的脉道处放血；状如剃头刀的手术器械，在肿胀部位处刮擦；状如镰刀，长约八指的器械，用于舌部的切割；膛口刀用于切除头部疮疡。
    穿刺用的器械：一般长约六指、状如蛙头尖端有侧壁孔，用于穿刺晕圈穴，排放心包积液、肝脓肿；中空管状探针，形似竹尖笔，用于穿刺腹水；针尖似鸟嘴者，用于穿刺胸部脓肿；尖端状如青稞粒者，用于穿刺脊椎的痞块；蛙头探针用于穿刺肺、心、小肠、大肠、肾等处的疾病最为合适；铜针，其尖端状如荞麦，用于刮眼翳；长约一卡，形如牛舌的探针，用于口腔穿刺；形似矛尖的探针，用于穿刺四肢的脓肿。
    各种小件器械：双锋锛、犊唇刀，形状如果麻马的嘴，长度约六指，有手柄的器械，这些都是铜铁合金所制，用于检查头部骨折的器械；锯齿形，宽二指，齿细密，长度约十指长手术锯，用于割除残骨余渣；锋利的剪刀，用于剪断疮伤的筋脉；长度约五指，管状锯齿型的骨钻，用于钻骨；长度约十指的犊唇刀，刀尖弯曲，用于切除耳、鼻、喉部的疹疱；子宫刀，长约一卡，尖端呈钩状，用来钩取死胎；蛇头针，用来取出结石；粗细如中等麦秆，坚而韧，中空呈管状，长度约十二指的探针，用于尿闭症的穿刺；尖端弯曲，长约十指的探针，用于烧灼虫齿；长度约十指，根部的小孔约五指，尖端裂口，用于鼻孔熏烟；管状，长度约十二指，小孔呈坡形，用于喉部喷药，烧灼小舌；腰部呈管状，其中部能容纳大拇指，顶端管中能容纳一个豆子，长度约八指，腰间装有轮子，此物称注射器，用于肛门塞入栓剂或灌肠，比它小的用于洗疮伤；用牛角制成的吸器，高约五指，宽约三指，尖端有孔能容纳一颗芥菜籽，用于吸取黄水；火罐，其腰围十八指，长约十二指，口圆形约四指，用于切除外部的痞块；铜制的似初二、初三日新月形状的剃刀，用于剃光头发；长度约十指的小斧，用于切除硬核大疮、疔疮。