萨迦寺被誉为“第二敦煌”，以保存着极其丰富的宗教、历史、文化遗产而享誉国内外。萨迦寺文物考古工作从2005年5月开始。

　　本次考古发现，修建于1268年的萨迦南寺是一座有两重城墙的城堡式寺院建筑，考古专家认为，这种具有完整立体防御功能特点的建筑，是吸收了内地城市建筑的成果。

　　除南寺外，考古人员也对北寺废墟进行了考古发掘。北寺最初是由吐蕃贵族昆氏家族于1073年修建，经过元代的不断扩展，发展成为拥有拉康（佛殿）、贡康（护法神殿）、颇章（宫殿）等的建筑群，但多毁于20世纪60年代。

　　另据了解，在这次考古工作中，共挖掘出元、明、清时代的各类文物900余件。